Я совершенно новичок в работе с многомерными данными. В настоящее время я пытаюсь выполнить t-SNE в R для моего набора данных. Когда я запускаю свой код (см. Ниже), функция Rtsne читает только матрицу 30x30. Мой набор данных - матрица 30х72, с 30 наблюдениями (строки) и 72 переменными (столбцы).
proclus.tSNE<-Rtsne(mydataset, dims = 2, perplexity=9, verbose=TRUE, max_iter = 5000)
Я не уверен, почему остальная часть моей матрицы не читается. Любая помощь будет принята с благодарностью.
mydataset - матрица значений экспрессии белка.
Спасибо!