Вы можете использовать обновление по запросу, чтобы сделать это:
{
"script": {
// fieldName is field you want to increment in document
"source": "ctx._source.fieldName=params.val", // counter increment by when query match
"lang": "painless",
"params": {
"i": 0,
"val": i+1,
}
},
"query": {
// your match condition
}
}