У меня проблема с вычислением значения каппа между двумя SNPMatrices в R.
Я сделал два значения SNP Matrices в R, используя 2 файла из 27 отдельных данных более 810 000 SNP
(каждый файл ped содержит 27 строк, которые представляют каждого человека, и более 810 000 столбцов, которые представляют данные SNP (аллели), и 27 человек в каждом файле ped - это одни и те же данные индивидов только с разным периодом времени.)
Я использовалirr пакет для вычисления значения каппа между двумя матрицами SNP.
irr::kappa2(cbind(matrix(q), matrix(w)))
В приведенном выше коде q и w являются двумя матрицами SNP.Но возникает ошибка.
Ошибка в порядке (y): не реализованный тип 'raw' в 'orderVector1'
Как я могу исправить эту проблему?Или есть другой способ вычислить значение каппа между двумя SNPMatrices?