Форма выходного массива моей модели, которую я предполагаю использовать в качестве аргумента для анализа SAlib (SOBOL), не соответствует форме массива, в которой нуждается sobol.
- У меня есть массив параметров, имеющий форму (28,13), который создается функцией saltelli пакета SAlib.
- С другой стороны, моя модель вычисляет решение во многих временных точках, скажем, 200. В итоге у меня есть выходной массив (28,200)
- Я должен использовать этот выходной массив какаргумент для функции Соболя Соблиба.
- Но насколько я понимаю из примера в документе SAlib, входной аргумент Sobol должен иметь массив столбцов, такой как (28,)
То, что я хочуузнать, могу ли я сделать правильный вывод из документа SAlib, так как функция Sobol SAlib нуждается только в массиве столбцов?или я могу кормить его массивом (28 200)?
PS: на самом деле я попытался (28 200) и получил какую-то ошибку.Но я не уверен, поддерживает ли SAlib форму массива (28 200) или мой код содержит ошибку.
from SALib.sample import saltelli
from SALib.analyze import sobol,morris
from SALib.test_functions import Ishigami
input_dict = {}
problem = {'num_vars':13,'names':
['Rp1','Ra','Rv','Rp2','Cla','Csa','Clv','Csv','Emin','Emax','R1','R2','C1'],\
'bounds':[[1.0,2.0],[0.1,0.5],[0.01,0.1],[11.0,15.0],[0.1,1.5],[0.05,0.55],[30.0,50.0],[2.0,6.0],\
[0.001,0.45],[0.2,3.2],[25.0,42.0],[2.0,8.0],[15.0,19.0]]}
param_values = saltelli.sample(problem,1)
for count, param in enumerate(param_values):
input_dict[count] = param
kwargs = {}
kwargs['newly_defined_parameters']= input_dict
sol_dict = main(**kwargs) # main function solves the model and returns a solution dictionary
Моя модель выдает 8 выходных данных.Но я хочу сделать анализ чувствительности только для 1 выхода.Поэтому я беру эти выходные данные и загружаю их в массив my_sol.
my_sol = np.zeros((28,200))
for ps in range(28): #ps ---> parameter set
for tp in range(200): #tp ---> time point
my_sol[ps][tp]=sol_dict[ps][1][tp]
my_sol.shape
(28, 200)
А теперь часть анализа:
Si = sobol.analyze(problem,my_sol)
А теперь часть ошибки:
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-39-ab30c1d4df01> in <module>
----> 1 Si = sobol.analyze(problem,my_sol)
C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\SALib\analyze\sobol.py in analyze(problem, Y, calc_second_order, num_resamples, conf_level, print_to_console, parallel, n_processors, seed)
101
102 for j in range(D):
--> 103 S['S1'][j] = first_order(A, AB[:, j], B)
104 S['S1_conf'][j] = Z * first_order(A[r], AB[r, j], B[r]).std(ddof=1)
105 S['ST'][j] = total_order(A, AB[:, j], B)
ValueError: setting an array element with a sequence.