указание сравнений stat_compare_means - PullRequest
Новая
       6

указание сравнений stat_compare_means

0 голосов
/ 17 июня 2019

Я пытаюсь использовать ggpubr и ggplot2 для отображения значений на моих боксплотах. У меня есть несколько факторов.

Вот мой текущий код и сюжет: 

ggplot(dat.czm.annot.otu,aes(x=Antibiotics,y=counts,fill=Diet))+geom_boxplot(alpha=0.8)+
   geom_point(aes(fill=Diet,color=Time),size = 3, shape = 21,position = position_jitterdodge(jitter.width = 0.02,jitter.height = 0))+
   stat_compare_means(method = "t.test")+
   ggtitle(otu)+
#   scale_x_discrete(labels= c("I+","I-","bulk soil"))+
   ylab("counts")+
   theme(plot.title = element_text(size = 18, face = "bold"))+
   theme(axis.text=element_text(size=14),
         axis.title=element_text(size=14)) + 
   theme(legend.text=element_text(size=14),
         legend.title=element_text(size=14)) +
   theme(strip.text.x = element_text(size = 14))

Вот текущий сюжет: enter image description here

Я рассмотрел несколько примеров, в которых они указывают использование списка сравнений. Но я не понимаю, как это относится к двум факторам.
Любая помощь приветствуется. Спасибо,

...