Shopify вставляет стили и js для некоторых элементов на сайте внутри {{content_for_header}}, которые вы найдете в файле theme.liquid.
Этот тег содержит файлы shopify по умолчанию, а также файлы для некоторых интеграций и приложений. Например, если вы устанавливаете пиксель Facebook через shopify, код для него будет {{content_for_header}}
Невозможно контролировать, что идет к этому тегу напрямую. Если вам просто нужно изменить стиль, то я рекомендую просто перезаписать стили, в худшем случае, если вам нужно, использовать тег "!important"
в css