Вы выполняете необработанный запрос через API-интерфейс TypeORM.Когда вы запустите необработанный запрос, TypeORM вернет необработанные результаты, которые в данном случае являются массивом строк с вашего SQL-сервера.Вам нужно будет проанализировать результат, чтобы получить счет, например:
const key = "user_count";
const usercount= await connection.manager.query(`SELECT COUNT (*) as ${key} FROM User`);
expect(usercount.length).toEqual(1);
expect(usercount[0][key]).toEqual("32");
В качестве альтернативы вы можете использовать API хранилища, чтобы получить счет:
const usercount = await getRepository(User).count();
expect(usercount).toEqual(32);