Используйте медиазапрос для определения размера экрана, который вы считаете нужным для рабочего стола.
Например:
@media screen and (min-width: 1028px) {
ul.dropdown-menu li {
background-color: transparent;
}
}
Это будет предназначаться для носителей типа 'screen' и для размеров области просмотра с минимальной шириной '1028px'. Вам нужно будет самостоятельно поэкспериментировать с размером min-width.