Вместо left: $(window).width - 5
, вы можете попробовать right: 0
.
РЕДАКТИРОВАТЬ: Да, это было довольно глупо. Но, если я не ошибаюсь, они также должны быть заключены в кавычки, как в 'width': '5px' ,.
$("#scrollBar").css({
'height': $(window).height(),
'width': '5px',
'position': 'absolute',
'top': 0,
'right': 0,
'margin': 0
});