Переключатель FILTERTEST (как я почти уверен, задокументирован) работает только на текст , а не на изображении, которое содержит шаблон пикселей, которые выглядят как текст, или на векторной линии, которая выглядит как текст.
Без просмотра вашего EPS Я не могу сказать, является ли текст, на который вы жалуетесь, текстовым или нет, но я думаю, что нет.
Кстати, если вы хотите PNG, тогданет смысла преобразовывать EPS в PDF, просто визуализируйте EPS непосредственно в файл PNG.