Вот способ awk, функционирующий для вашего удовольствия:
awk '
function d2b(d, b) {
while(d) {
b=d%2b
d=int(d/2)
}
return(b)
}
{
print d2b($0)
}' file
Вывод первых трех записей:
1000000000000000001100001010
1000000000000000001000001010
1000000000000000000100000000