Я пытаюсь объединить несколько файлов в один, добавляя имя каждого файла в первом столбце. Я уже поставил заголовок и имя файла, но я не хочу полное имя файла
Спасибо
#!/bin/sh
for i in *.txt
do
head -1 $i | awk '{OFS="\t";print "Sample", $0}' > outputprueba.txt
break
done
for a in *bla.txt
do
sed 1d $a | awk -v x="'"$a"'" '{OFS="\t";print x, $0}' >> outputprueba.txt
done
I expect this output:
Sample Chr Start End
File1 chr1 10318652 10318652
File1 chr1 10322054 10322054
File2 chr1 132887500 132887500
File2 chr1 132888208 132888208
but the actual output is:
Sample Chr Start End
'File1_annotated_fastq_blablabla.txt' chr1 10318652 10318652
'File1_annotated_fastq_blablabla.txt' chr1 10322054 10322054
'File2_annotated_fastq_blablabla.txt' chr1 132887500 132887500
'File2_annotated_fastq_blablabla.txt' chr1 132888208 132888208