Я считаю, что вам нужно вызвать его конструктор, т. Е. require('autoprefixer')()
Я вижу это в PostCss Loader README .
{
test: /\.css$/,
use: [
'style-loader',
'css-loader',
{
loader: 'postcss-loader',
options: {
ident: 'postcss',
plugins: [
require('autoprefixer')({...options}), // calls constructor with optional options
...,
]
}
}
]
}