Массовое убийство операция экономит время. Сделай это в самом MySql:
Выполнить эти команды
mysql> select concat('KILL ',id,';') from information_schema.processlist
where user='root' and time > 200 into outfile '/tmp/a.txt';
mysql> source /tmp/a.txt;
Ссылка
---------edit------------
, если вы не хотите хранить в файле, сохраните в variable
Просто запустите в командной строке
> out1=$(mysql -B test -uroot -proot --disable-column-names -e "select concat('KILL ',id,';') from information_schema.processlist where user='root' and time > 200;")
> out2= $(mysql -B test -uroot -proot --disable-column-names -e "$out1")