Вы можете активировать свою виртуальную среду Python с помощью этой команды
source activate yourenvname
затем измените каталог и перейдите в исходный каталог ../../PythonFiles/ и введите
start pythonw Main.pyw
Это поможет запустить скрипт python в фоновом режиме & Если вы не хотите работать в фоновом режиме и держать терминал открытым, удалите pyw, измените его на расширение py, затем запустите его.