Я думаю, что невозможно выполнить миграцию для нескольких баз данных за один раз.Вы должны вызывать команду миграции для каждой отдельной строки подключения в цикле.
Вы можете вызывать ее программно с помощью C # или создать скрипт Powershell, который запускает migrate.exe.
Мы используемВторой вариант в нашем развертывании, так что миграции баз данных являются явным шагом в конвейере выпуска.
Migrate.exe имеет параметр для предоставления строки подключения.Подробнее см. здесь .