Спасибо моему другу Тому, вот хорошее решение:
#scroll on the page
webscroll <- remDr$findElement("css", "body")
webscroll$sendKeysToElement(list(key = "end"))
Я поместил этот код между переходом на страницу и захватом ссылок, что привело к тому, что веб-сайт подумал, что я правильно его использую, чтобы я мог очистить ссылки.