установить rgdal на Ubuntu 18.04 - PullRequest
Новая
       28

установить rgdal на Ubuntu 18.04

0 голосов
/ 04 июня 2019

Я пытаюсь установить rgdal на Ubuntu 18.04.

Сообщение об ошибке, которое я имею сейчас: 

configure: R_HOME: /usr/lib/R
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++ -std=gnu++11
configure: C++11 support available
configure: rgdal: 1.4-4
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 833
checking for gdal-config... /home/kchen/anaconda3/bin/gdal-config
checking gdal-config usability... yes
configure: GDAL: 2.3.3
checking C++11 support for GDAL >= 2.3.0... yes
checking GDAL version >= 1.11.4... yes
checking GDAL version <= 2.5 or >= 3.0... yes
checking gdal: linking with --libs only... no
checking gdal: linking with --libs and --dep-libs... no
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libdapserver.so.7: undefined reference to `uuid_generate@UUID_1.0'
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libdapserver.so.7: undefined reference to `uuid_unparse@UUID_1.0'
collect2: error: ld returned 1 exit status
/home/kchen/anaconda3/lib/libcurl.so: undefined reference to `SSL_CTX_set_ciphersuites@OPENSSL_1_1_1'
/home/kchen/anaconda3/lib/libcurl.so: undefined reference to `SSL_CTX_set_post_handshake_auth@OPENSSL_1_1_1'
/home/kchen/anaconda3/lib/libcurl.so: undefined reference to `SSL_CTX_set_keylog_callback@OPENSSL_1_1_1'
collect2: error: ld returned 1 exit status
configure: Install failure: compilation and/or linkage problems.
configure: error: GDALAllRegister not found in libgdal.
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’

Я сделал следующее, прежде чем пытаться установить 'rgdal' в R 

$ sudo apt-get upgrade libgdal-dev
$ sudo apt-get upgrade libproj-dev
$ sudo apt-get upgrade gdal-bin

Не уверен, что еще я должен попробовать. Заранее спасибо!

1 Ответ

2 голосов
/ 04 июня 2019

Сначала необходимо установить зависимые библиотеки. R также должно быть> 3.3.0. 

sudo apt-get install libgdal1-dev libproj-dev

Если это не сработает, убедитесь, что вы установили C ++ 

g++: command not found

Это также лучшее решение для установки R-пакетов из консоли, а не внутри R, поскольку каждый пользователь на машине будет иметь доступ к пакету. В противном случае он просто будет в вашей личной библиотеке. 

sudo su - -c "R -e \"install.packages('rgdal', repos='http://cran.rstudio.com/')\""
...