Я полагаю, что проблема в том, как вы храните данные в своей БД, а не в FCKEditor - я разместил более 300 страниц текста без получения ошибки, которую вы описываете.
Я бы попробовал повторить все, что публикуется. Поместите эту строку кода вверху сценария, в который вы отправляете сообщение.
echo '$_POST = '. htmlentities(var_export($_POST, 1)); die;
Если я прав, ваша проблема в том, что MySQL усекает данные, которые вы в нее помещаете. Эту проблему трудно увидеть в стандартных отчетах об ошибках MySQL.