Awk для нескольких шаблонов для файла переменной длины

Question

Я пытаюсь найти несколько шаблонов, где бы я указывал начало и конец первых нескольких символов.Это работает для одного шаблона.

awk '/test_pattern/ { match($0, /test_pattern/); print substr($0, RSTART - 10, RLENGTH + 20);' file

Как мне сделать несколько шаблонов?Файл основан не на столбцах, а на разделителях.Спасибо.

Вот пример для одной строки.

X;Y;AC=1;AN=31388;AF=3.18593e-05;0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|1|0|0|0|0|0|0|AC_CAT=4.5;X;X;X;X;AC_DOG=4.6; X;X;X;AC_PUT=5.4

Я пытаюсь получить все, что начинается с AC, AF и AN.В то же время мне нужны первые два столбца, если это возможно.

Ожидаемый результат:

X     Y    AC=1    AF=3.18593e-05  AC_CAT=4.5   AC_DOG=4.6   AC_PUT=5.4

Спасибо.

Answer 1

Я думаю, что вы исключили столбец AN= из ожидаемого результата случайно, так как вы сказали в своем вопросе I am trying to get everything that begins with AC, AF and AN, и вы на самом деле просто хотите, чтобы все столбцы name=value были напечатаны. Если так:

$ cat tst.awk
BEGIN { FS="[;|]"; OFS="\t" }
{
    printf "%s%s%s", $1, OFS, $2
    for (i=3; i<=NF; i++) {
        if ($i ~ /=/) {
            printf "%s%s", OFS, $i
        }
    }
    print ""
}

$ awk -f tst.awk file
X       Y       AC=1    AN=31388        AF=3.18593e-05  AC_CAT=4.5      AC_DOG=4.6      AC_PUT=5.4

Answer 2

если ваши данные в файле 'd', попробуйте gnu awk:

awk 'BEGIN{FPAT="A[CFN][A-Z_]*=[0-9.]+"} {for(i =1; i<=NF;i++) print $i" "}' d