Использование rmarkdown :: run ("mydoc.Rmd", auto_load = FALSE) позволяет избежать перезагрузки пакетов, и рендеринг происходит быстрее.Есть аналогичная опция для перехода в скрипт уценки.
---
runtime: shiny
auto_reload: false
title:
output:
html_document:
toc: yes
toc_float: yes
number_sections: yes
css: style.css
---
просто не работает