Программное обеспечение Repeatmasker: проблема с вызовом - PullRequest
Новая
       24

Программное обеспечение Repeatmasker: проблема с вызовом

0 голосов
/ 05 июня 2019

Я использовал программное обеспечение repeatmasker, установив -species для моего анализа. когда я запускаю командную строку: $ /home/pc/RepeatMasker -species danio -gff -s genome.fa он сообщает мне это сообщение: 

RepeatMasker version development-$Id: RepeatMasker,v 1.332 2017/04/17 19:01:11 rhubley Exp $
Search Engine: NCBI/RMBLAST [ 2.6.0+ ]
Master RepeatMasker Database: /home/pc/RepeatMasker/Libraries/RepeatMaskerLib.embl ( Complete Database: dc20181026-rb20181026 )


Building species libraries in: /home/pc/RepeatMasker/Libraries/dc20181026-rb20181026/danio
   - 260 ancestral and ubiquitous sequence(s) for danio
   - 2325 lineage specific sequence(s) for danio
,

    RepeatMasker::createLib(): Error invoking /home/pc/anaconda/pkgs/rmblast-2.6.0-h4422958_0//bin/makeblastdb on file /home/pc/RepeatMasker/Libraries/dc20181026-rb20181026/danio/specieslib.

Кто-нибудь знает, в чем проблема?

...