Создание цикла с Compare_means - PullRequest
Новая
       2

Создание цикла с Compare_means

1 голос
/ 05 июня 2019

Я пытаюсь создать цикл для использования compare_means (библиотека ggpubr в R) по всем столбцам в кадре данных, а затем выбираю только значимые значения p.adjusted, но это не работает должным образом.

Вот код 

head(df3)
sampleID    Actio   Beta    Gammes  Traw    Cluster2
gut10   10  2.2 55  13  HIGH
gut12   20  44  67  12  HIGH
gut34   5.5 3   89  33  LOW
gut26   4   45  23  4   LOW


library(ggpubr)
data<-list()
for (i in 2:length(df3)){
data<-compare_means(df3[[i]] ~ Cluster2,  data=df3, paired = FALSE,p.adjust.method="bonferroni",method = "wilcox.test") 
}
Error: `df3[i]` must evaluate to column positions or names, not a list

Я хотел бы создать вывод для преобразования в dataframe со всей информацией, содержащейся в выводе compare_means Большое спасибо

...