Публикация комментариев @Nancy в качестве вики-ответа сообщества будет более заметной.
Решение:
1) Создание каталога во время сборки образа докера
2) Для запуска сценария укажите точку входа в сборке Docker или укажите ее в файле развертывания в спецификации контейнера в виде команды:
["/bin/bash"] args: [ "-c", "cd /opt/ && python3.6 efg.py" ]
Кроме того, если вам нужен envпеременная, которая будет экспортирована в модуль, вы можете указать в файле развертывания.Есть и другие способы, но это сработало для ОП.