Вам не нужно определять новую версию для каждого небольшого изменения, которое вы делаете в POM.
Версия означает специфические особенности артефакта (в POM это настройки сборки), я бы объявил одну версию и заставил бы все проекты использовать эту версию (использование версии SNAPSHOT - отличная идея). Если вы делаете небольшое обновление, сделайте это в этой версии. Если вы сделаете большее изменение, вы можете объявить новую версию и иметь все новые POM для использования этой версии, таким образом вы избежите разрушения старых проектов с помощью нового супер POM.