CUDA: как сделать умножение матриц с использованием тяги? - PullRequest
0 голосов
/ 09 мая 2019

Я новичок в CUDA и Thrust, и я пытаюсь реализовать умножение матриц, и я хочу добиться этого, используя только алгоритмы тяги, потому что я хочу избежать вызова ядра вручную.

Есть ли способ, которым я могу добиться этого эффективно? (По крайней мере, без использования 2 вложенных для циклов)

Или я должен уйти в отставку и вызвать ядро ​​CUDA?

//My data
thrust::device_vector<float> data(n*m);
thrust::device_vector<float> other(m*r);
thrust::device_vector<float> result(n*r);

// To make indexing faster, not really needed
transpose(other);

// My current approach
for (int i = 0; i < n; ++i)
{
   for (int j = 0; j < r;++j)
   {
       result[i*r+ j] = thrust::inner_product(data.begin()+(i*m), data.begin()+((i+1)*m),other+(j*m), 0.0f);
   }
}

1 Ответ

0 голосов
/ 10 мая 2019

Если вас интересует производительность (обычно, почему люди используют графические процессоры для вычислительных задач), вы не должны использовать Thrust и не должны вызывать или писать свое собственное ядро ​​CUDA. Вы должны использовать библиотеку CUBLAS. Если вы хотите изучить свое собственное ядро ​​CUDA, вы можете обратиться к оптимизированной для первого уровня версии CUDA в руководстве по программированию CUDA в разделе общей памяти . Если вы действительно хотите использовать толчок с одним вызовом толчка, это возможно.

Основная идея заключается в использовании поэлементной операции, такой как thrust :: transform, как описано здесь . Точечный продукт для каждого элемента массива вычисляется с помощью функтора, состоящего из цикла.

Вот рабочий пример, в котором рассматриваются 3 метода. Ваш оригинальный метод двойного вложенного цикла (относительно медленный), метод вызова с одним толчком (более быстрый) и метод cublas (самый быстрый, конечно, для больших размеров матрицы). Приведенный ниже код запускает метод 1 только для размеров стороны матрицы, равных 200 или менее, поскольку он очень медленный. Вот пример на Tesla P100:

$ cat t463.cu
#include <thrust/device_vector.h>
#include <thrust/transform.h>
#include <thrust/inner_product.h>
#include <thrust/execution_policy.h>
#include <thrust/equal.h>
#include <thrust/iterator/constant_iterator.h>
#include <cublas_v2.h>
#include <iostream>
#include <time.h>
#include <sys/time.h>
#include <cstdlib>
#define USECPSEC 1000000ULL

long long dtime_usec(unsigned long long start){

  timeval tv;
  gettimeofday(&tv, 0);
  return ((tv.tv_sec*USECPSEC)+tv.tv_usec)-start;
}

struct dp
{
  float *A, *B;
  int m,n,r;
  dp(float *_A, float *_B, int _m, int _n, int _r): A(_A), B(_B), m(_m), n(_n), r(_r) {};
  __host__ __device__
  float operator()(size_t idx){
    float sum = 0.0f;
    int row = idx/r;
    int col = idx - (row*r); // cheaper modulo
    for (int i = 0; i < m; i++)
      sum += A[col + row*i] * B[col + row*i];
    return sum;}
};

const int dsd = 200;
int main(int argc, char *argv[]){
  int ds = dsd;
  if (argc > 1) ds = atoi(argv[1]);
  const int n = ds;
  const int m = ds;
  const int r = ds;
  // data setup
  thrust::device_vector<float> data(n*m,1);
  thrust::device_vector<float> other(m*r,1);
  thrust::device_vector<float> result(n*r,0);
  // method 1
  //let's pretend that other is (already) transposed for efficient memory access by thrust
  // therefore each dot-product is formed using a row of data and a row of other
  long long dt = dtime_usec(0);
    if (ds < 201){
    for (int i = 0; i < n; ++i)
    {
      for (int j = 0; j < r;++j)
      {
         result[i*r+ j] = thrust::inner_product(data.begin()+(i*m), data.begin()+((i+1)*m),other.begin()+(j*m), 0.0f);
      }
    }
    cudaDeviceSynchronize();
    dt = dtime_usec(dt);
    if (thrust::equal(result.begin(), result.end(), thrust::constant_iterator<float>(m)))
      std::cout << "method 1 time: " << dt/(float)USECPSEC << "s" << std::endl;
    else
      std::cout << "method 1 failure" << std::endl;
    }
  thrust::fill(result.begin(), result.end(), 0);
  cudaDeviceSynchronize();
// method 2
  //let's pretend that data is (already) transposed for efficient memory access by thrust
  // therefore each dot-product is formed using a column of data and a column of other
  dt = dtime_usec(0);
  thrust::transform(thrust::counting_iterator<int>(0), thrust::counting_iterator<int>(n*r), result.begin(), dp(thrust::raw_pointer_cast(data.data()), thrust::raw_pointer_cast(other.data()), m, n, r));
  cudaDeviceSynchronize();
  dt = dtime_usec(dt);
  if (thrust::equal(result.begin(), result.end(), thrust::constant_iterator<float>(m)))
    std::cout << "method 2 time: " << dt/(float)USECPSEC << "s" << std::endl;
  else
    std::cout << "method 2 failure" << std::endl;
// method 3
  // once again, let's pretend the data is ready to go for CUBLAS
  cublasHandle_t h;
  cublasCreate(&h);
  thrust::fill(result.begin(), result.end(), 0);
  float alpha = 1.0f;
  float beta = 0.0f;
  cudaDeviceSynchronize();
  dt = dtime_usec(0);
  cublasSgemm(h, CUBLAS_OP_T, CUBLAS_OP_T, n, r, m, &alpha, thrust::raw_pointer_cast(data.data()), n, thrust::raw_pointer_cast(other.data()), m, &beta, thrust::raw_pointer_cast(result.data()), n);
  cudaDeviceSynchronize();
  dt = dtime_usec(dt);
  if (thrust::equal(result.begin(), result.end(), thrust::constant_iterator<float>(m)))
    std::cout << "method 3 time: " << dt/(float)USECPSEC << "s" << std::endl;
  else
    std::cout << "method 3 failure" << std::endl;
}
$ nvcc -o t463 t463.cu -lcublas
$ ./t463
method 1 time: 20.1648s
method 2 time: 6.3e-05s
method 3 time: 5.7e-05s
$ ./t463 1024
method 2 time: 0.008063s
method 3 time: 0.000458s
$

Для случая измерения 200 по умолчанию метод одиночного вызова и метод cublas довольно близки, но намного быстрее, чем метод цикла. Для бокового размера 1024 метод cublas почти в 20 раз быстрее, чем метод вызова с одной тягой.

Обратите внимание, что я выбрал "оптимальные" конфигурации транспонирования для всех 3 методов. Для метода 1 лучший вариант синхронизации - это когда inner_product использует «строку» из каждой входной матрицы (фактически, транспонирование 2-й входной матрицы). Для метода 2 лучший вариант синхронизации - это когда функтор проходит «столбец» из каждой входной матрицы (фактически, транспонирование первой входной матрицы). Для метода 3 выбор CUBLAS_OP_T для обеих входных матриц представляется наиболее быстрым. В действительности, только метод cublas обладает гибкостью, которая может быть полезна для различных входных случаев с хорошей производительностью.

...