К сожалению, единственный способ сделать это - извлечь информацию об управлении исходным кодом из соответствующих .pdb (используя pdbstr) и использовать эту информацию для замены путей сборки путями контроля версий.
Жаль, что у WinDbg нет простого способа сделать это, учитывая, что у него уже есть информация.