И еще год спустя ...
Я исправил эту проблему (F12, git 1.7.2.3):
vi .git/gitweb/gitweb.cgi # set DocumentRoot to <root>/.git/gitweb.cgi
GITWEB_CONFIG=.git/gitweb lighttpd -f .git/gitweb/httpd.conf
Я не стал копать дальше, чтобы понять, зачем мне это нужно ...