IANAL, так что не принимайте это как авторитетное.
Насколько я понимаю, вы НЕ МОЖЕТЕ продавать их через корпоративный веб-сайт. Что вы можете сделать, это заставить их купить лицензию iPhone Enterprise и управлять своими собственными профилями распространения, а затем предоставить им копию, подписанную с помощью учетной записи предприятия. Это ничем не отличается от найма подрядчика для написания внутреннего приложения, за исключением того, кто имеет фактический источник.
Сказав это, вам действительно нужно поговорить с юристом и попросить его рассмотреть различные контракты, это не проблема программирования.