Использование параллельного режима для извлечения шаблонов из огромного файла и печати каждого шаблона в новый файл.

Question

Я пытаюсь напечатать искомые шаблоны, используя grep, из файла в новые файлы, каждый из которых содержит шаблон, но, поскольку исходный файл огромен, это занимает много времени.Я стремлюсь к чему-то на этих линиях:

cat All_microbes_nonewline.fna | parallel --pipe --block 2000M -j5 fgrep -A1 -f {} < kunju.txt > {}.fna

Не могли бы вы помочь мне с этим?

Answer 1

Я считаю, что это то, что вы ищете:

параллельный --pipe --block 2000M grep pattern