Приложение .NET Core не может добавить ссылку на приложение UWP и наоборот.
Что вам нужно сделать, это создать проект .NET Standard, в котором вы устанавливаете Entity Framework Core и определяете свой DbContext
.
Затем вы можете ссылаться на этот проект как из консольного приложения .NET Core, так и из приложения UWP.