Изменения для добавочных обновлений версий не должны быть большой проблемой.
Если вы используете систему контроля версий, что вам и нужно, то это будет относительно тривиально.
создать отдельную ветку, изменить версию всех проектов.
если вы используете TFS, если я правильно помню, так как я не трогал это много лет, вы просто проверяете файлы, и если что-то идет не так, вы отменяете действия редактирования.