Один из способов сделать это - выгрузить только информацию о сборке Python из base в файл требований, а затем использовать ее для создания нового env.Это гарантировало бы, что Python буквально такой же, как в base .
conda list -n base --export | grep "^python=" > base-py.txt
conda create -n mynewenv --file base-py.txt
Или если вы хотите использовать однострочник, который избегает временный файл:
conda create -n mynewenv --file <(conda list -n base --export | grep "^python=")