Как объединить вертикально две строки, полученные с помощью grep?

Question

Я использую команду grep для выбора некоторых полей в файле. Эта команда выбирает N (N = 2 в примере ниже) блоков по 5 разделенных пробелами полей каждый и возвращает переменную, содержащую эту строку, которая называется firstPart:

chr8 aa1 bb1 cc1 dd1 chr8 aa2 bb2 cc2 dd2 

Также второе выполнение grep возвращает строку, содержащую N блоков из 5 разделенных пробелами полей, которая называется secondPart и содержит:

SLC7A2 ee1 ff1 gg1 hhh1 SLC7A2 ee2 ff2 gg2 hhh2

Я хотел бы знать, какую команду bash я мог бы использовать для помещения firstPart и secondPart в массив из N элементов, где первый блок каждого элемента связан с его соответствующим вторым блоком. Выход должен быть:

chr8 aa1 bb1 cc1 dd1 SLC7A2 ee1 ff1 gg1 hhh1
chr8 aa2 bb2 cc2 dd2 SLC7A2 ee2 ff2 gg2 hhh2

Есть идеи у кого-нибудь?

Answer 1

Почти наверняка есть лучший способ сделать то, что вы пытаетесь сделать, но, поскольку у вас уже есть ответы на заданный вопрос, вот еще:

$ firstPart='chr8 aa1 bb1 cc1 dd1 chr8 aa2 bb2 cc2 dd2'
$ secondPart='SLC7A2 ee1 ff1 gg1 hhh1 SLC7A2 ee2 ff2 gg2 hhh2'

$ read -r -a fp <<< "$firstPart"
$ read -r -a sp <<< "$secondPart"

$ fmt="$(eval "printf '%%s %.0s' {1..$(( ${#sp[@]} / 2 - 1 ))}")%s\n"

$ paste -d' ' <(printf "$fmt" "${fp[@]}") <(printf "$fmt" "${sp[@]}")
chr8 aa1 bb1 cc1 dd1 SLC7A2 ee1 ff1 gg1 hhh1
chr8 aa2 bb2 cc2 dd2 SLC7A2 ee2 ff2 gg2 hhh2

Answer 2

Предупреждение: это ответ на вопрос "если у меня есть две строки N блоков по 5 пустых разделенных слов каждый, как я могу получить массив из N элементов, где каждый элемент i содержит блок i из первой и второй строки? "

Однако почти наверняка есть лучший способ решения вашей основной проблемы. В частности, мой ответ совершенно не зависит от того, как вы получили строки, но, скорее всего, всю проблему можно решить с помощью одной команды awk.

Вот как я бы решил то, что вы на самом деле спросили в Bash:

#!/usr/bin/env bash

firstPart='chr8 aa1 bb1 cc1 dd1 chr8 aa2 bb2 cc2 dd2'
secondPart='SLC7A2 ee1 ff1 gg1 hhh1 SLC7A2 ee2 ff2 gg2 hhh2'
N=2
for ((i = 0; i < N; ++i)); do
    printf -v arr[i] '%s %s' \
        "$(cut -d ' ' -f $((1 + i * 5))-$((5 + i * 5)) <<< "$firstPart")" \
        "$(cut -d ' ' -f $((1 + i * 5))-$((5 + i * 5)) <<< "$secondPart")"
done

printf '%s\n' "${arr[@]}"

Команда cut расширяется до чего-то вроде

cut -d ' ' -f 1-5

для первых блоков, затем

cutd -d ' ' -f 6-10

для вторых блоков и т. Д. Оператор printf объединяет эти выходные данные и сохраняет их в выходном массиве arr с индексом i.

Выход

chr8 aa1 bb1 cc1 dd1 SLC7A2 ee1 ff1 gg1 hhh1
chr8 aa2 bb2 cc2 dd2 SLC7A2 ee2 ff2 gg2 hhh2