Я начинаю выполнять работу по оптимизации sql,
но я не знаю, как правильно настроить MySQL, чтобы он регистрировал медленные запросы.
Эта ссылка может быть для некоторой помощи:
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/slow-query-log.html