В таких очень больших измерениях (9000) вы, скорее всего, будете страдать от проклятия размерности, я бы предложил запустить алгоритм уменьшения размерности (например, PCA или T-SNE) до использования алгоритма кластеризации в таком очень высоком размеры.
Подробнее о методах уменьшения размерности можно прочитать здесь
Вы также можете больше узнать о проклятии размерности и о том, почему трудно найти значимые кластеры в больших измерениях здесь .