Вы указали конкретный ссылочный номер + «1» или «3». Но когда вы пишете запрос выбора, вы передаете «0» вместо «1», здесь
cursor = db.query(TABLE_PAPER, new String[] {KEY_PAPER_ID,
KEY_PAPER_AMOUNT,
KEY_PAPER_DATE,
KEY_PAPER_REFERENCE,
KEY_PAPER_PAID},KEY_PAPER_REFERENCE + "=?" + " AND " + KEY_PAPER_PAID + "=?" + " OR " + KEY_PAPER_PAID + "=?",
new String[]{String.valueOf(rowId), "1", "3"},
null, null, "date DESC");
Вы должны передать в запросе «1» вместо «0».