Я использую конвейер ChAMP для анализа данных метилирования.Я пытаюсь использовать champ.runCombat для исправления пакетных эффектов, но получаю следующую ошибку:
Error in champ.runCombat(beta = myNorm, pd = myLoad$pd, variablename =
"PCL", :
slide factors is not valid to run Combat, please recheck your dataset.
myCombat <- champ.runCombat(beta=myNorm,pd=myLoad$pd, variablename="PCL", batchname = c("slide"))