Вы можете попробовать использовать канонический формат URI:
curl --proxy http://proxyuser:proxypass@httpproxyhost:8080 -v 'ftp://ftpuser:ftppass@ftphost/file'
С wget вы можете использовать такую команду:
ftp_proxy=http://proxyuser:proxypass@httpproxyhost:8080 wget ftp://ftpuser:ftppass@ftphost/file