Если вы хотите этого очень много ...
Вы можете управлять цветами, которые будут циклически проходить, используя cycler
.
from matplotlib import pyplot as plt
from cycler import cycler
ax = plt.subplot(111)
ax.set_prop_cycle(cycler('color', ['black', 'green']))
ax.plot([[1,2],[5,6]])
