Чтобы сделать это в java, потребуется разбор JSON и создание экземпляров Mallet.Я считаю, что анализ JSON JSON затруднен, потому что язык хочет иметь типы для каждого объекта.
Я бы лично предложил преобразовать файл JSON в формат "svmlight", принятый Маллетом, с использованием сценария Python или аналогичного.