ОК, поэтому решение, которое я нашел, состояло в том, чтобы создать вторую php-страницу, на которой печатается флот-диаграмма, и затем вызвать эту страницу из диалога jqmodal.
Надеюсь, это поможет. Возможно, есть лучшее решение, но этот хак, похоже, дает желаемый эффект.