после fabian указал, что невозможно указать одну сторону, не затрагивая другие стороны, так как заполнение - это одно свойство, это решение, которое я придумал, которое работало для моего конкретного случая ия надеюсь, что кто-то найдет это полезным
Insets old = region.getPadding();
int rightPadding = 45;
region.setPadding(new Insets(old.getTop(), rightPadding , old.getBottom(), old.getLeft()));