Один хороший трюк - это просмотреть ваш сгенерированный HTML (View Source) из вашего браузера и проверить, что ваши css и js файлы «доступны», нажав на ссылки ...
Но в вашем случае яможно увидеть следующее ...
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="<?= base_url()?>public/css/bootstrap.min.css" media="screen" />
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="<?= base_url()?>public/css/style.css" media="screen" />
<script type="text/javascript" src="<?= base_url()?>puplic/js/jquery.js"></script>
<script type="text/javascript" src="<?= base_url()?>puplic/js/bootstrap.js"></script>
Ваши css файлы находятся в папке public , НО ваши js файлы находятся в папке puplic .
Так это просто опечатка?