Я изменил 2 java файла глубоко в моей структуре каталогов относительно корня проекта. В корне моего проекта я дал команду git add --all, а затем git commit -m "some message". Git только добавил файлы, которые изменились в корне проекта, и git push только передал измененные файлы в корне проекта в удаленный git. Когда я вручную попытался добавить файлы и сделать коммит, git сказал, что изменений нет, и, следовательно, коммит был проигнорирован.
Как мне заставить git распознавать измененные файлы?