Попробуйте это:
defmodule My do
def mapdna(dna)
when is_binary(dna) do
%{"G" => "C","C" => "G","T" => "A", "A" => "U"}[dna]
end
end
#IO.puts My.mapdna(:G)
IO.puts My.mapdna("G")
В elixir, чтобы проверить, является ли аргумент строкой, которую вы используете is_binary/1
.
Запуск кода:
$ elixir my.exs
C
Но, если я раскомментирую закомментированную строку:
$ elixir my.exs
** (FunctionClauseError) no function clause matching in My.mapdna/1
The following arguments were given to My.mapdna/1:
# 1
:G
my.exs:3: My.mapdna/1
my.exs:12: (file)
(elixir) lib/code.ex:677: Code.require_file/2
Ответ на комментарий:
Посмотрите на этот код:
defmodule RNATranscription do
@rna_for %{"G" => "C","C" => "G","T" => "A", "A" => "U"}
def to_rna(dna) do
String.codepoints(dna)
|> Enum.map( &(@rna_for[&1]) )
|> :erlang.list_to_binary
end
end
В iex:
~/elixir_programs$ iex my.ex
Erlang/OTP 20 [erts-9.3] [source] [64-bit] [smp:4:4] [ds:4:4:10] [async-threads:10] [hipe] [kernel-poll:false]
Interactive Elixir (1.6.6) - press Ctrl+C to exit (type h() ENTER for help)
iex(1)> RNATranscription.to_rna "ACGT"
"UGCA"
iex(2)>
Приведенное выше решение не будет очень эффективным для ДЕЙСТВИТЕЛЬНО длинных строк ДНК (оно разбивает строку на список, затем перебирает полученный список, преобразуя значения, а затем обходит список ещеснова объединить все вместе).Для длинных цепочек ДНК вы можете использовать binary pattern matching
, чтобы получить каждую букву в цепочке ДНК и построить строку РНК по мере продвижения.Согласно документам erlang для двоичных файлов , следующее решение должно быть высоко оптимизированным способом построения строки РНК - даже если вы добавляете к «хвосту» строки РНК:
defmodule RNATranscription do
@rna_for %{"G" => "C","C" => "G","T" => "A", "A" => "U"}
def to_rna(dna) do
_to_rna(dna, <<>>) #The second arg will hold the rna string as it's being built
end
defp _to_rna(<<dna_letter::utf8, rest::binary>>, rna_string) do
rna_letter = @rna_for[<<dna_letter::utf8>>]
_to_rna(rest, <<rna_string::binary, rna_letter::binary>>)
end
defp _to_rna(<<>>, rna), do: rna
end
Обратите внимание, что dna_letter
в конечном итоге является кодовой точкой (целое число), и она должна быть преобразована обратно в двоичный файл (строку) с <<....>>
для поиска на карте.При сопоставлении двоичных файлов вы не можете использовать шаблон, подобный следующему:
<<dna_letter::binary, rest::binary>>
, поскольку тип ::binary
имеет размер по умолчанию, равный «остальной части двоичного файла, который вы пытаетесь сопоставить» (хотяВы можете явно указать размер).В результате, ::binary
без размера может появиться только один раз в шаблоне, и это должно быть в конце шаблона.(С другой стороны, размер по умолчанию для ::utf8
- это все байты, составляющие одну кодовую точку utf8, что составляет максимум 4 байта).
Теперь, поскольку все ваши буквы ДНК - это буквы ascii,т. е. всегда длиной 1 байт, вы также можете сопоставить строки ДНК, используя этот шаблон:
<dna_letter::binary-size(1), rest::binary>>
Первый сегмент в шаблоне явно устанавливает размер для типа binary
, поэтому он будет соответствовать только одному байтуи dna_letter в конечном итоге будет двоичным (строка), что означает, что вам не придется преобразовывать кодовую строку в строку для поиска на карте.Вот новый шаблон, добавленный к решению:
defmodule RNATranscription do
@rna_for %{"G" => "C","C" => "G","T" => "A", "A" => "U"}
def to_rna(dna) do
_to_rna(dna, <<>>) #The second arg will hold the rna string as it's being built
end
defp _to_rna(<<dna_letter::binary-size(1), rest::binary>>, rna_string) do
rna_letter = @rna_for[dna_letter]
_to_rna(rest, <<rna_string::binary, rna_letter::binary>>)
end
defp _to_rna(<<>>, rna), do: rna
end
Интересно, эквивалентна ли строка:
_to_rna(rest, <<acc::binary, rna::binary>>)
:
_to_rna(rest, acc <> rna)
??Если это так, код может использовать еще несколько идиом эликсира:
defmodule RNATranscription do
@rna_for %{"G" => "C","C" => "G","T" => "A", "A" => "U"}
def to_rna(dna) do
_to_rna(dna, "") #The second arg will hold the rna string as it's being built
end
defp _to_rna(<<dna_letter::binary-size(1)>> <> rest, rna_string) do
rna_letter = @rna_for[dna_letter]
_to_rna(rest, rna_string <> rna_letter)
end
defp _to_rna("", rna_string), do: rna_string
end