Кажется, я вспоминаю эту проблему, но только периодически (и я думаю о более старой версии Eclipse). Я так и не нашел причину, но я подозревал, что утечка памяти произошла, потому что, скорее всего, это произойдет, чем дольше будет открыто Eclipse, т.е. это случалось после того, как я сделал несколько успешных экспортов.
Моим «решением» было перезапустить Eclipse перед экспортом. По памяти это всегда решало проблему.