Поскольку вы упоминаете PHP, может быть, вам нужны или включены файлы через http-запросы вместо локального диска?
Что-то вроде следующего может привести к тому, что PHP включит файл, но получит его через http-запрос, который обслуживается вашим веб-сервером. По сути, «связь с собой».
include 'http://www.example.com/file.php?foo=1&bar=2';
Или, может быть, вы где-то определили Константу ПУТЬ , ожидая сделать:
require _PATH_ . "/file.php";
Пока PATH на самом деле путь, все будет хорошо, но если вы случайно установите его в качестве URL-адреса, вы заставите требование снова пройти через веб-сервер. Не очень эффективно.
Проверьте ваш код или журналы для таких подключений.