private_key.pek - это зашифрованный закрытый ключ, необходимый для регистрации существующих приложений в App Signing by Play.Он используется только тогда, когда вы уже опубликовали приложение в Play Store и хотите передать свой закрытый ключ в Google, чтобы они могли подписывать APK тем же ключом, что и ваши предыдущие версии.
Для новых приложений GoogleВы можете сами сгенерировать ключ (так как предыдущих версий нет), поэтому вам не нужно ничего передавать.
Таким образом, вы можете удалить этот файл, он вам не понадобится.
Дополнительную информацию о процессе регистрации можно найти по адресу https://support.google.com/googleplay/android-developer/answer/7384423?hl=en-GB