Оба приложения должны иметь достаточно точное поле даты (временная метка в SQL, я не припоминаю конкретную в DBF). Каждый раз, когда вы обновляете поле, вы также обновляете это поле.
Таким образом, чтобы синхронизировать обе базы данных, вам просто нужно сравнить идентификатор записи + поле даты, чтобы найти записи, которые необходимо обновить.